烘后粮食的温度很高，需要冷却后才能入仓储存。塔式粮食烘干机设有冷却段，冷风机负责向冷风段内提供冷空气，采用逆流冷却方式对烘后粮进行降温。在冷却过程中，冷空气先接触下部的低温粮食，在向上运行的同时吸收粮食中的热量，冷空气温度逐渐升高，这样可避免冷风与上层热粮接触时粮食的急剧冷却，逆流冷却既可以提高冷却段的冷却效果，还可以保护粮食的品质不受影响。经过冷却段，粮温从上至下逐渐降低。当塔内粮温冷却到比环境温度高4-8摄氏度以内后，粮食由排粮段排出，入仓储存。当气温低于0摄氏度时，粮温控制在0摄氏度即可。在生产中可通过检测冷却废气的温度来判断粮食的冷却程度。
   卸粮段包括卸料口、循环输送机、观察孔和排粮装置。观察孔主要用来观看塔内粮食的排放情况。常用的排粮装置分为栅板式和六叶轮式两种结构。栅板式排粮机构由漏粮斗、排粮栅板、曲柄连杆等部件组成，正常不排粮时排粮栅板挡在漏斗下方，需要排粮时，在曲柄连杆机构的作用下，带动固定排粮栅板的板框作往复运动，使排粮栅板与漏粮斗时而分开，时而重合，用于控制排粮速度。六叶轮式排粮装置由漏粮斗、六叶轮和调速电机等组成，六叶轮挡在漏粮斗处，需要排粮时，调速电机带动六叶轮旋转，粮食顺势而下，六叶轮的转速控制着排粮的速度。从排粮装置下来的粮食通过卸料口流到循环输送机上。循环输送机除了输送粮食之外，还可以通过反向输送，将经过一次干燥并未达到安全水分的粮食，再重新送回提升机进料口，进而对粮食进行再次装塔干燥，干燥循环次数由粮食水分高低而定，此时粮食烘干机进入循环式干燥状态。